Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rims1Q99NE5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rims1Q99NE5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms