Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms