Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl3Q99N95 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms