Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms