Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ms4a4dQ99N05 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ms4a4dQ99N05 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ms4a4dQ99N05 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ms4a4dQ99N05 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ms4a4dQ99N05 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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