Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bbc3Q99ML1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms