Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms