Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms