Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q99KU6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q99KU6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q99KU6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q99KU6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q99KU6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q99KU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q99KU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q99KU6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99KU6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99KU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99KU6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99KU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99KU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99KU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99KU6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms