Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DhddsQ99KU1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms