Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf34Q99KR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf34Q99KR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms