Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms