Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Me2Q99KE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms