Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms