Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfxn4Q925N1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn4Q925N1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms