Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripply3Q924S9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms