Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim59Q922Y2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms