Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Clip1Q922J3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clip1Q922J3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms