Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tm4sf4Q91XD3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm4sf4Q91XD3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms