Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps3Q91VB4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps3Q91VB4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms