Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp4Q8VHC5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cabp4Q8VHC5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms