Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms