Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SnrkQ8VDU5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms