Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sft2d2Q8VD57 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d2Q8VD57 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d2Q8VD57 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d2Q8VD57 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d2Q8VD57 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d2Q8VD57 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms