Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt25Q8VCW2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms