Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms