Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1mtQ8R4U6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1mtQ8R4U6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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