Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms