Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StradbQ8K4T3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms