Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw1Q8K4P8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms