Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lgi3Q8K406 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lgi3Q8K406 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lgi3Q8K406 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lgi3Q8K406 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lgi3Q8K406 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lgi3Q8K406 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgi3Q8K406 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lgi3Q8K406 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgi3Q8K406 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms