Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc12Q8K2L8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc12Q8K2L8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc12Q8K2L8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc12Q8K2L8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc12Q8K2L8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms