Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms