Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms