Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek9Q8K1R7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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