Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms