Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LgsnQ8CIX8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms