Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tshz3Q8CGV9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms