Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms