Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms