Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms