Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms