Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc87Q8CDL9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms