Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Riox2Q8CD15 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riox2Q8CD15 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms