Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ufl1Q8CCJ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms