Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nhlrc3Q8CCH2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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