Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

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Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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