Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spef2Q8C9J3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms