Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm9949Q8C9F4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9949Q8C9F4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9949Q8C9F4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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