Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Amigo3Q8C2S7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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